在降脂效果上，瑞舒伐他汀相较于阿托伐他汀具有更强的血脂降低能力。瑞舒伐他汀在较低剂量5至10毫克时就能有效地降低血脂，而阿托伐他汀则需要10至20毫克的剂量才能达到相似的效果。
在药物的亲水性和亲脂性方面，瑞舒伐他汀表现为亲水性，而阿托伐他汀则是亲脂性。亲脂性药物较易穿过血脑屏障，这可能导致中枢神经系统的不良反应。
至于药物的代谢途径，阿托伐他汀主要通过CYP3A4酶进行代谢，而瑞舒伐他汀则主要通过CYP2C9和CYP2C19酶。这一差异可能会影响到药物与其他药物或食物的相互作用，并在必要时需要调整用药。
在肝损害的风险上，阿托伐他汀有可能导致转氨酶水平的升高，而瑞舒伐他汀引起这种情况的可能性较低。因此，对于肝功能受损的患者，瑞舒伐他汀可能是更合适的选择。
阿托伐他汀有2%的成分通过肾脏代谢，而瑞舒伐他汀则有10%通过肾脏代谢。这意味着对于肾功能不全的患者，阿托伐他汀可能更为适用。
虽然两种药物在降脂强度上都非常有效，但瑞舒伐他汀在降脂效果上略胜一筹。
在逆转动脉粥样硬化斑块的能力上，有研究显示，每日使用瑞舒伐他汀10毫克或阿托伐他汀20毫克连续6个月，两种药物都能显著逆转斑块的发展，而瑞舒伐他汀在这方面的效果似乎更佳。