性病的空窗期简单而言就是接受性病检查之前的等候期。当你感染了性病 (不论艾滋病病毒或其他性病)，就算立即进行检查，也不会得到阳性的结果，这是由于当病毒或细菌等进入身体后，需要一段时间才达至可检测的水平，如此同时，身体亦会制造抗体去对抗病毒或细菌，同样地，身体亦需要一段时间才能制造足够的抗体以达至可检测的水平，这段时间称为空窗期。应因不同的性病及检测方法，空窗期的长短亦各有不同，传统的抗体检测需要身体有足够的抗体才能检测得到，因此一般有较长的空窗期；随着的技术的发达，亦相继出现了性病的DNA检测，由于是检测病毒或病菌本身的基因物质，所需检测数量较少，因此空窗期一般较抗体检测短。
至于潜伏期则是指由感染性病到发病中间的一段时间，感染性病后，不后立即出现病征，待潜伏期过后身体便会出现相关病征。不同的性病，潜伏期的长短会有所不同：
| 性病 | 潜伏期 |
|---|---|
| 艾滋病病毒 | 十年至十五年 |
| 单纯疱疹 (二型) 病毒 | 二至五日 |
| 性病疣 (低危型HPV) | 数星期至八个月不等，但亦可能超过一年 |
| 梅毒 | 九至九十日不等 |
| 淋病 | 二至五日 |
| 衣原体 | 二至四周 |