生殖器疱疹的潜伏期一般为14天或以内。
大多数人都不会有任何明显征状,或不会察觉有任何征状。有些人被感染后平均2-7天就可能出现征状,但亦有可能潜伏在体内达数星期、数月甚至数年亦未察觉。因此,当患者出现征状,并不代表他/她是新感染的。
由于是第一次病发,患者的免疫系统还没完全预备好,症状会比较明显。患者出现征状,通常会遵循一个模式,患者可能会出现以下部分或全部征状:
第一次病发一般会持续2至4周,然后皮肤会慢慢结痂愈合。
疱疹病毒在第一次病发后,会潜伏在患者体内,当患者生病、受其他病毒感染、营养不良、压力过大或有任何降低身体抵抗力的因素,都可能使生殖器疱疹感染复发。
生殖器单纯疱疹2型病毒疱疹复发时,征状一般与第一次病发相似,但是症状通常比首次感染时温和,及会在较短时间内痊愈,症状一般约持续一星期左右。至于由单纯疱疹1型病毒引起的生殖器疱疹则往往不常复发。
生殖器疱疹复发的频率因人而异,大多每年4至5次,也有少数人一个月内1至2次,或1至2年一次,通常第一年的复发次数较多,之后会逐年减少。